Geenianalüüs vähi korral kõigil patsientidel
taust
Vähihaigused võivad tekkida mitmesugustest keskkonnamõjudest ja umbes 5–10% on pärilikud. Need võivad olla seotud konkreetsete geenimutatsioonidega, mille tuvastamisel on tänapäeval otsustav mõju teraapiaotsustele, riski minimeerivatele sekkumistele ja vähihaiguste ennetamisele mõjutatud patsientide lähedastele. Pärilik eelsoodumus esineb eriti rinna-, eesnäärme- ja käärsoolevähi korral.
Kehtivad suunised toetavad geneetilist testimist, kui esineb mitu tegurit. Nende hulka kuuluvad muu hulgas spetsiifilised kasvaja patoloogilised omadused, diagnoosimise vanus ja perekondlik vähktõbi. Siiski on ainult üksikud uuringud, kus üldiselt uuritakse geneetiliste muutuste levimust vähihaigetel ilma eelneva valikuta, nagu juhistes täpsustatud.
Eesmärkide seadmine
Uuringus uuritakse, kas vähipatsientide geneetilise testimise üldine lähenemisviis võimaldab tuvastada rohkem pärilikke geneetilisi muutusi kui suunispõhine lähenemine.
metoodika
Prospektiivne uuring hõlmas vähipatsiente, kellele oli tehtud vähivastane ravi tahke kasvaja tõttu Mayo kliiniku (USA) neljas vähikeskuses ja rühmapraktikas Wisconsinis. Kõigil patsientidel testiti 84 geeni muutusi järgmise põlvkonna sekveneerimise (NGS) abil. Varasemat patsiendi valikut vähi tüübi, haiguse staadiumi, rahvuse, vanuse või perekonna ajaloo põhjal ei tehtud. NGS-i tulemusi võrreldi kehtivate suuniste järgi määratud tulemustega.
Tulemused
Patsiendi omadused
Uuringusse kaasati 2994 vähihaiget keskmise vanusega 61,4 ± 12,2 aastat. 1582 patsienti (53,0%) olid mehed. Diagnoositud vähiliikide hulka kuulusid rinna-, käärsoole-, kopsu-, munasarja-, pankrease-, eesnäärme- ja emakavähk.
Praeguse haiguse staadiumi järgi saab iseloomustada 535 patsienti (18,6%), 0 / I staadiumi, 477 patsienti (16,7%) II etappi, 593 patsienti (20,7%) III etappi ja 1257 patsienti (43,9%). määratakse geneetilise analüüsi ajal IV etappi. Perekonnaajalugu võttes teatas 1019 patsienti (34,1%), et esimese astme sugulasel on ka vähk.
NGS-i analüüsi tulemused
Patogeenne mutatsioon tuvastati kokku 397 patsiendil (13,3%). Neist 282 patsiendil (70%) oli mõõduka (n = 133) kuni kõrge (n = 149) läbitungivusega geenid, mis suurendas vähiriski ja 1415 patsiendil (47,4%) ilmnes tundmatu tähendusega geenivariant. Selle tagajärjel muudeti vähiravi 42 patsiendil (28,2%), kellel avastati kõrge penetrantsusega geenid. Muudatused hõlmasid: kirurgilist ravi, immunoteraapiat, kemoteraapiat või kaasamist kliinilisse uuringusse, mis oli võimalik ainult nende tulemuste põhjal.
Katsemeetodite võrdlus
NGS-analüüsi kasutava üldise katsemeetodi abil tuvastati 192 patsienti (6,4% kõigist patsientidest ja 48,4% tuvastatud patogeensete mutatsioonidega patsientidest), keda poleks avastatud, kui oleks läbi viidud suunistele vastav testimeetod (fenotüüp või perekonna ajalugu). Neist 83 patsiendil (43,2%) oli keskmine läbitungivus ja 35 patsiendil (18,2%) kõrge läbitungivus.
Perekonna ajalugu ja tagajärjed
Patogeensed geenimutatsioonid iduliinil avastati ainult patsientidel, kellel vähk tekkis noorelt (<50 aastat) (tõenäosuse suhe: 1,38; 95% CI: 1,06-1,78). Geneetiline analüüs pakuti nende patsientide lähedastele tasuta. Ainult 70 patsiendi 176 sugulast (17,6%) võttis selle pakkumise vastu. Patogeensed geenimutatsioonid avastati ka 79 sugulasel (45%).
Järeldus
Vähipatsientide geneetilise analüüsi üldine lähenemisviis võimaldab tuvastada kliiniliselt olulisemaid mutatsioone, eriti iduliini mutatsioone, kui praegustes juhistes soovitatud spetsiifiline lähenemine. Ühel kaheksast testitud patsiendist avastati pärilikud geneetilised variatsioonid, mida ei oleks suunisele vastava analüüsiga tuvastatud. Näiteks selles uuringus sai sellest uudsest lähenemisviisist kasu peaaegu 30%, kuna nende vähiteraapiat sai käesoleva analüüsi põhjal optimeerida.
Kuid näidati ka seda, et vaid vähesed sugulased, kellel on päriliku vähihaigusega pereliige, kasutasid ka testimise pakkumist ära. Näib, et sotsiaalmajanduslikud ja emotsionaalsed aspektid moodustavad siin barjääri, mis tuleb murda.
Kokkuvõtlikult tuleks kaaluda üldise geneetilise analüüsi läbiviimist igal vähihaigel pärast diagnoosi määramist. NGS-i arendamisega on tänased kulud hallatavad ja säästavad tervishoiusüsteemile pikas perspektiivis palju raha.