Eesnäärmevähk: uus indeks kasvaja agressiivsuse ennustamiseks

Raske otsustamine vajaliku ravi jaoks

Ainuüksi Saksamaal diagnoositakse eesnäärmevähk aastas umbes 60 000 mehel. Pärast seda diagnoosi on paljude inimeste ees raske otsus: kas operatsioon või kiiritusravi on vajalik või piisab lokaliseeritud kasvajate aktiivsest jälgimisest? Paljude patsientide jaoks on see võimalus, et vältida invasiivse ravi mõnikord märkimisväärseid kõrvaltoimeid.

Teadlased analüüsisid mutatsiooniprotsesse ja eesnäärme kasvajate arengut

Varasemate eesnäärmevähi somaatiliste muutuste tuvastamine võib anda olulise ülevaate kasvaja arengust ja aidata vähkide stratifitseerimisel kõrge ja madala riski järgi.

Analüüsisid Clarissa Gerhäuser ja tema kolleegid DKFZ-st koos Kopenhaageni ülikooli ja Euroopa molekulaarbioloogia laboratooriumi (EMBL), Hamburg-Eppendorfi ülikooli meditsiinikeskuse, Max Plancki molekulaargeneetika instituudi ja Berliini Charité ülikooli meditsiini teadlastega. varases staadiumis kogu 292 eesnäärmekasvaja genoom, transkriptoom ja metüüloom. Koeproovid pärinesid patsientidelt, kellel diagnoositi vanus ≤55 aastat.

Varased, pidevalt arenevad ensüümide vahendatud mutatsiooniprotsessid

Teadlased leidsid vanusega seotud muutused genoomis ja ensüümide vahendatud mutatsiooniprotsessi, mis progresseerub aja jooksul, mis aitab kaasa eesnäärmevähi varasematele mutatsioonidele. Mutatsiooniprotsessi käivitavad arvatavasti APOBEC3 ensüümid. APOBECi ensüümide rühm on osa imetajate kaasasündinud immuunsüsteemist. Nad kahjustavad teatud viiruste geneetilist koosseisu ja vähendavad seeläbi nende elujõulisust.

Teiselt poolt on vähki soodustavate mutatsioonide põhjustajana juba tuvastatud üliaktiivsed APOBECi ensüümid. "Eeldame, et APOBEC muudab eesnäärme rakke iga rakujagunemisega aeglaselt, kuid pidevalt. Nii et võib-olla 20 aasta jooksul koguneb 10 kuni 20 mutatsiooni, ”ütleb kaasautor Jan Korbel EMBList.

Neli erineva riskitasemega molekulaarset alarühma

Kasutades epigeneetilisi markereid, töötas Clarissa Gerhäuser välja "PEPCI" - epigeneetilise eesnäärmevähi indeksi, mis võimaldab kasvaja agressiivsust hõlpsalt ennustada. Kasutades epigeneetiliste markerite ja geeniekspressioonimustrite integreerivat analüüsi, tuvastasid teadlased neli kasvajate molekulaarset alarühma, mis erinevad haiguse kulgu.

ESRP1 lookus: võimalik prognoosimarker

Eriti agressiivses, väga kiiresti jagunevas kasvajate alarühmas ilmnevad ESRP1 (epiteeli splaissimist reguleeriva valgu 1) geeni dubleerimised ja suurenenud ekspressioon. Teadlased kinnitasid selle seose 12 000 koeproovi abil. ESRP1 mutatsioon on seetõttu paljulubav kandidaat prognostiliseks markeriks, mida saab tuvastada vähi varajases staadiumis.

DNA järjestuse andmed võimaldavad ennustada kliinilisi tulemusi

Teadlased ühendasid arvutimudelis teabe molekulaarsete omaduste ja haiguse arengu rühmaspetsiifilise riski kohta. Praegu rakendatakse PRESCIENTi kliinilises hoolduses Berliini Charite'is. Teadlased soovivad mudelisse lisada mitme tuhande patsiendi andmeid. Umbes kahe kuni kolme aasta pärast võiks mudeli rakendada kliiniliste protsesside lahutamatu osana ja aidata ennustada, kuidas eesnäärmevähk konkreetsel patsiendil areneb.